Mancha-de-alternaria, causada pelo fungo Alternaria alternata, pode atacar desde o estado de plântula e provocar desfolhação e redução dos rendimentos. Caracteriza-se pela produção de machas e necroses foliares. É um patógeno cosmopolita, mas em algodão só é importante no Brasil e China. É um patógeno que tem amplo círculo de hospedeiros.
